تغییرات ساختاری ژن مقاومت به زنگ قهوه‌ای Lr35 در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان (Triticum aestivum L.)

Authors

اهری‌زاد, سعید گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز

محمدی, سید ابوالقاسم گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز

همتی گوگه, رحیمه گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز

Abstract:

زنگ قهوه‌ای از بیماری‌های مهم گندم است که باعث کاهش عملکرد آن می‌شود. تولید ارقام مقاوم یکی از راهکارهای اصلی کنترل بیماری‌ زنگ گندم است. لازمه این عمل، شناخت ژنتیک مقاومت و ژن‌های مقاومت به بیماری است. در این مطالعه با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس داده‌های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI)، قطعاتی بطول 351-340 جفت باز از ژن Lr35 تکثیر شد. قطعات پس از همسانه‌سازی، توالی‌یابی شدند. بلاست توالی قطعات تکثیری از ژن Lr35 در ژنوتیپ‌های مورد مطالعه، شباهت 95 درصد با توالی ژن Lr35 گندم نان از NCBI نشان داد. علاوه بر این، توالی‌های حاصل دارای شباهت 93 درصد با ژن Lr21 از کلون کاسمیدی 1–7–69 Aegilops tauschii، 87 درصد با ژن گلوتنین A با وزن مولکولی بالا از Triticum turgidum، 84 درصد با ژن پلاستیدی‌استیل کوآنزیم آ کربوکسیلاز (Acc–1) ازT. turgidum و ژن‌های مقاومت به سفیدک پودری و تحمل به سرمای گندم نان بود. توالی‌های تکثیری با استفاده از سه جفت آغازگر، دارای یک چارچوب قرائت آزاد، به‌ترتیب به‌طول 162، 156 و 160 جفت‌باز بوده و پروتئین‌هایی بطول 54، 52 و 54 اسیدآمینه رمز کردند. بررسی ساختار توالی-ها نشان دهنده وجود ناحیه غنی از لوسین، از نواحی حفاظت شده در ژن‌های مقاومت به بیماری‌ها در گیاهان بود. تجزیه خوشه‌ای براساس توالی قطعات تکثیری از ژن Lr35 با استفاده از جفت آغازگر دوم ژنوتیپ‌ها را براساس پاسخ به زنگ آن‌ها گروه بندی کرد. نسبت جایگزینی های نامشابه به مشابه نشان دهنده نقش احتمالی گزینش مثبت و یا گرینش ایجاد کننده تنوع در تغییرات نوکلئوتیدی این ژن بود. با توجه به وجود تفاوت‌های نوکلئوتیدی بین ژنوتیپ‌های مقاوم، نیمه مقاوم و حساس، می‌توان از آن ها برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر SNPها جهت شناسایی ارقام حساس و مقاومت به زنگ قهوه‌ای در گندم استفاده کرد.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

تغییرات ساختاری ژن مقاومت به زنگ قهوه ای lr۳۵ در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان (triticum aestivum l.)

زنگ قهوه ای از بیماری های مهم گندم است که باعث کاهش عملکرد آن می شود. تولید ارقام مقاوم یکی از راهکارهای اصلی کنترل بیماری زنگ گندم است. لازمه این عمل، شناخت ژنتیک مقاومت و ژن های مقاومت به بیماری است. در این مطالعه با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس داده های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (ncbi)، قطعاتی بطول 351-340 جفت باز از ژن lr35 تکثیر شد. قطعات پس از همسانه سازی،...

full text

تغییرات ساختاری ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای (leaf rust) در ارقام مقاوم و حساس گندم نان

چکیده ندارد.

15 صفحه اول

شناسایی ژنوتیپ‌های متحمل به تنش خشکی در ژنوتیپ های گندم نان (.Triticum aestivum L)

به‌منظور شناسایی ژنوتیپ‌های گندم متحمل به تنش خشکی در گلخانه و مزرعه، 30 ژنوتیپ به‌عنوان فاکتور فرعی به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب طرح کاملاً تصادفی و بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در شرایط بدون تنش (آبیاری به‌صورت متداول تا آخر فرایند رشد گیاه صورت گرفت) و تنش خشکی مرحله گلدهی (آبیاری تا مرحله گلدهی به‌صورت متداول و طبیعی انجام گرفت و تنش خشکی بعدازآن مرحله اعمال گردید) در سال 96-1395 در گل...

full text

تنوع نوکلئوتیدی نواحی ژنومی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای Lr29 و Lr47 در لاین های گندم نان (Triticum aestivum L.)

full text

بررسی واکنش ژنوتیپ های گندم نان (Triticum aestivum L.) به تنش شوری

بررسی واکنش ژنوتیپ های گندم نان (Triticum aestivum L.) به تنش شوری مسعود گماریان1*، محمد علی ملبوبی2، فرخ درویش3، سید ابوالقاسم محمدی4، خدیجه رضوی2 1- عضو هیات علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد اراک 2- عضو هیات علمی پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری 3- استاد گروه زراعت واصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران 4- دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز تاریخ...

full text

شناسایی نشانگرهای مولکولی پیوسته با ژن Lr34/Yr18و ارزیابی مقاومت به زنگ‌ قهوه‌ای و زنگ زرد در ارقام و لاین‌های امید بخش گندم نان (Triticum aestivum L.)

زنگ قهوه‌ای (Puccinia triticina) و زنگ زرد (Puccinia striiformis) از مهمترین و رایجترین بیماریهای گندم در اغلب کشورهای جهان محسوب شده و نقش چشمگیری در کاهش محصول گندم دارند. انتقال ژنهای مقاومت به ارقام گندم یکی از مؤثرترین و اقتصادی‌ترین روش‌های مبارزه با این بیماریها است. یکی از ژنهایی که باعث القای مقاومت و پایداری مقاومت گیاه نسبت به زنگ قهوهای و زرد گندم میشود، ژن Lr34/Yr18 است. د...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title

علوم زراعی ایران

volume 12 issue 4

pages 499- 509

publication date 2011-01

unfollow

{@ msg @}

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com